- 島根県指定有形文化財
- 天球儀、地球儀 - 堀田仁助作
- 紙本著色日本国地理測量之図、紙本著色東三拾三国沿岸測量之図 - 伊能忠敬の測量図を高橋景保が模写
- 展示物
- 『元武公虎狩之図』(栗本格斎画 朝鮮出兵時在陣中亀井茲矩虎狩絵図)
- 『贈虎礼状』(豊臣秀吉礼状 祐筆長束正家書)
- 『四葉榊前立当世具足一式』(藩士新井七兵衛道具)
- 『因幡鹿野城瓦』(亀井氏略紋)
- 『山水図』(多胡逸斎画)
- 『三代藩主茲親筆掛軸』(題字:愛 人皆炎熱苦我夏日長愛)
- 『七代藩主矩貞作 御庭焼』(藩主製作 広皿焼物 三点)
- 『藩校養老館扁額』(八代藩主矩賢揮毫)
- 『十一代藩主茲監着用直垂』
- 『因州記』(文久元年湯舎人著 絵付旅日記 譲伝寺亀井茲矩二五〇年法要参列旅程記録)
- 『津和野城下絵図 掛軸三幅組』(栗本格斎画)
- 『艱民図』(山本栞谷画 明治天皇陛下献上品副)
- 『養蚕之図』(山本栞谷画)
- 『岡熊臣肖像』(山本栞谷画)
- 『邯鄲醒夢図』(山本栞谷画)
- 『犬追物図』(大島松渓画)
- 『城内欄干白兎彫刻』(大島松渓作)
- 『新春三鶴図』(岡野洞山画)
- 『山水図』(多胡逸斎画)
- 『上杉久輿入道具』(竹雀紋、上杉茂憲伯爵五女)
- 『亀井修子御食初道具』(亀井氏紋、亀井茲常伯爵長女)
- 『神狐像』一対他(北白川宮妃富子殿下奉納)
- 『西周 詩軸』(詩:田畑麦秀畝東西飛棗花開樹保紅野客眠閑 餐渡酥白鷗飛静止強風)
- 『西周 散人刀』(西周遺品 鯤を模す木剣、裏面は鯤の伝承を語る荘子の漢詩を翻刻、落款有)
- 『西周 接遇御礼書軸』(書:人何須緑蟻 明治十四年五月津和野旅寓)
- 他
- 非展示物
- 『桜廼舎文庫』(岡熊臣蔵書、岡熊臣著『日本書紀私伝』を含む)
- 『椋木潜文庫』(志士椋木潜蔵書、明治期の広範な学術文献及教育文献中心、三十五箱四百拾六部弐千六百四拾八冊)
- 『佐伯利麿文庫』(佐伯利麿蔵書)
- 『江戸三十三間堂図』(尾形月耕画)
- 『山水図』(山本栞谷画)
- 『聖人図』(山本栞谷画)
- 『盧公図』(山本栞谷画)
- 『秋血盧図』(山本栞谷画)
- 『鶴亀図』(岡野洞山美髙画)
- 『賛珠図』(岡野洞山画)
- 『松鶴図』(岡野洞渕画 岡野氏初代 三代藩主茲親に召抱えられた)
- 『近江八景図』(岡野洞渕画)
- 『花鳥図』(三浦紫畹画)
- 『四季花鳥屏風』(三浦紫畹画 二枚折屏風)
- 『梅之図』(三浦紫畹画)
- 『孔雀之図』(三浦紫畹画)
- 『秋色之図』(加部嚴夫画 大國門下 画を野口幽谷に学ぶ)
- 『鶴画 自画賛』(大國隆正自画賛)
- 『吉賀記』(尾崎太左衛門著)(写本:太皷谷稲成神社本、吉賀津和野地域古伝・歴代藩公出自事績等を紀伝体にて収む、装丁は無頁及び崩れ有)
- 『藩邸常備槍』(藩邸常備武具、鞘に亀井家家紋)
- 他